Ph.D. Student Computational Imaging in Electron Microscopy

vor 4 Wochen


Erlangen, Deutschland Friedrich-Alexander-Universität Erlangen-Nürnberg Vollzeit

The ECLIPSE Lab of Prof. Dr. Philipp Pelz at FAU Erlangen-Nürnberg offers a position as

Your Tasks

Develop and test new approaches and algorithms for large-scale multi-dimensional (3D/4D/5D), multi-modal reconstruction of electron-microscopy datasets at the atomic-, nano-, and microscale Design, optimize, and execute multidimensional Scanning Transmission Electron Microscopy experiments Publish and present the results of these studies to the community.

Your Profile

Necessary qualifications:

M.Sc. in computer science, computational engineering, physical sciences, materials science, applied mathe-matics or a related discipline. Proficiency in scientific Python programming. Experience with machine learning frameworks such as PyTorch, TensorFlow, Jax Excellent communication and interpersonal skills to be able to interact effectively with a diverse group of sci-entists and technical staff. Self-motivated and able to work in a team environment.

Desirable qualifications:

Background in diffraction physics, crystallography, or modern microscopy methods Data acquisition at aberration-corrected STEMs Developing and deploying AI models. Background in Computer Vision or Computational Imaging Demonstrated record of collaborative software development, especially in distributed teams.

Additional Information

Our group develops advanced algorithms for efficient processing, reliable reconstruction, and automated information extrac-tion from multidimensional microscopy datasets, predominantly in electron and X-ray microscopy. We have expertise in deep learning, large-scale optimization, signal and image processing, and experimental design for advanced X-ray and electron microscopy experiments.

We have for the first time reconstructed large phase-contrast volumes at atomic resolution beyond the traditional limits of electron microscopy. Your project will revolve around further developing the algorithms and applying them to image challenging materials systems, like metal-organic frameworks and other beam-sensitive materials. We offer access to state-of-the-art aberration-corrected electron microscopes and a lab-based x-ray microscope at the Center for Nanoanalysis and Electron Microscopy, access to high-performance computing resources at the Er-langen National High-Performance Computing Center, and the enthusiastic support of an early-career principal inves-tigator.

For informal inquiries, please get in touch with Philipp Pelz (). Applications from underrepresent-ed minorities are particularly welcome. Your application (in English or German) must include a motivation letter and your CV. Applications will be accepted until the position is filled.

Release date: 19.04.2024



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  • Erlangen, Deutschland Friedrich-Alexander-Universität Erlangen-Nürnberg (FAU) Vollzeit

    Der Lehrstuhl für Mikro- und Nanostrukturforschung (IMN) und das Center for Nanoanalysis and Electron Microscopy (CENEM) der Friedrich-Alexander-Universität Erlangen-Nürnberg (FAU) suchen zur Verstärkung ihres Teams eine engagierte TEAMASSISTENZ (M/W/D) IN TEILZEIT (50%) IHR AUFGABENGEBIET: * Selbstständige Durchführung von organisatorischen und...


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  • Erlangen, Deutschland Universitätsklinikum Erlangen Vollzeit

    Universitätsklinikum Erlangen Medizinische Klinik 5 - Hämatologie & Internistische Onkologie Prof. Dr. Frederik Graw Ulmenweg 18 91054 Erlangen Ihre Ansprechperson bei Fragen Prof. Dr. Frederik Graw, Medizinische Klinik 5, AG-Leiter **Tel.**: 09131 - 85 47601 PhD position in Computational Immunology (M/F/d) **Veröffentlicht seit**:...


  • Erlangen, Deutschland Friedrich-Alexander-Universität Erlangen-Nürnberg (FAU) Vollzeit

    Der Lehrstuhl für Mikro- und Nanostrukturforschung (IMN) und das Center for Nanoanalysis and Electron Microscopy (CENEM) der Friedrich-Alexander-Universität Erlangen-Nürnberg (FAU) suchen zur Verstärkung ihres Teams eine engagierte Teamassistenz (m/w/d) in Teilzeit (50%) Dienstreiseverwaltung: Planung, Organisation und Abrechnung von Dienstreisen ...


  • Erlangen, Deutschland Friedrich-Alexander-Universität Erlangen-Nürnberg Vollzeit

    Der Lehrstuhl für Mikro- und Nanostrukturforschung (IMN) und das Center for Nanoanalysis and Electron Microscopy (CENEM) der Friedrich-Alexander-Universität Erlangen-Nürnberg (FAU) sucht zur Verstärkung seines Teams eine engagierte Teamassistenz (m/w/d) in Teilzeit (50 %). Dienstreiseverwaltung: Planung, Organisation und Abrechnung von Dienstreisen ...


  • Erlangen, Deutschland Universitätsklinikum Erlangen Vollzeit

    Universitätsklinikum Erlangen Medizinische Klinik 5 - Hämatologie & Internistische Onkologie Prof. Dr. Frederik Graw Ulmenweg 18 91054 Erlangen Ihre Ansprechperson bei Fragen Prof. Dr. Frederik Graw, Medizinische Klinik 5 AG-Leiter **Tel.**: 09131 - 85 47601 PhD position in Computational Immunology (M/F/d) **Veröffentlicht seit**:...


  • Erlangen, Bayern, Deutschland Friedrich-Alexander-Universität Erlangen-Nürnberg Vollzeit

    Die FAU Erlangen-Nürnberg sucht für den Lehrstuhl für Entwicklungsbiologie, Prof. Dr. Elke Ober, zum nächstmöglichen Zeitpunkt eine/einen Ihre Aufgaben The Liver Development and Regeneration group of Professor Elke Ober in the division of developmental biology at the Friedrich-Alexander Universität (FAU) Erlangen-Nürnberg is seeking a highly motivated...


  • Erlangen, Deutschland Friedrich-Alexander-Universität Erlangen-Nürnberg Vollzeit

    Qualifikationen : Background in cell and/or developmental biology Background working with zebrafish Microscopy and image analysis experience Good command of English to navigate the scientific field Permission to work with animals Stellenzusatz Befristetes Forschungsvorhaben The Ober group seeks to decipher the molecular and cellular interactions of...


  • Erlangen, Deutschland Universitätsklinikum Erlangen Vollzeit

    State-of-the-art medicine and nursing care you can rely on! - Since being founded in 1815, Universitätsklinikum Erlangen has offered medicine of the highest standard and incorporated the latest insights from medical research and state-of-the-art equipment into diagnosis and therapy. More than 9.500 employees from approximately 50 different occupations are...


  • Erlangen, Deutschland Friedrich-Alexander-Universität Erlangen-Nürnberg Vollzeit

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  • Erlangen, Deutschland Friedrich-Alexander-Universität Erlangen-Nürnberg Vollzeit

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  • Erlangen, Deutschland Friedrich-Alexander-Universität Erlangen-Nürnberg Vollzeit

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  • Erlangen, Deutschland Friedrich-Alexander-Universität Erlangen-Nürnberg (FAU) Vollzeit

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  • Erlangen, Deutschland Friedrich-Alexander-Universität Erlangen-Nürnberg - Karriere Vollzeit

    Biointerfaces Lab is offering Ihre Aufgaben Master Thesis (1): Synthesis of Magnetic Nanomaterials The Biointerfaces Labs (Prof. Dr. Danijela Gregurec) is offering a Master Thesis in the field of synthesis of magnetic nanomaterials. Anisotropic geometries in magnetic nanostructures have been described by our group (Gregurec et al., 2021) with...


  • Erlangen, Deutschland Friedrich-Alexander-Universität Erlangen-Nürnberg Vollzeit

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  • Postdoc (Tv-l e 13)

    Vor 6 Tagen


    Erlangen, Deutschland Friedrich-Alexander-Universität Erlangen-Nürnberg Vollzeit

    **Das Aufgabengebiet umfasst u. a.**: Conduct experiments with animal and human cells and tissues and document the results - Analyze and present data in weekly lab meetings and on conferences - Participate in the supervision and instruction of MD or PhD students and dissertations - Write and publish scientific articles - Write or contribute to grant...