Leitung der Abteilung Bioinformatik und Genomforschung

Das Institut für Humangenetik der Universität Regensburg, dass sich mit verschiedenen Aspekten der erblichen Grundlagen verschiedener menschlicher Krankheiten befasst, ist eine der Überbrücckungsverbindungen zwischen klinischen medizinischen Disziplinen und den Naturwissenschaften.

• Vertragsarten: Vollzeit,Teilzeit

• Die Möglichkeit zur eigenverantwortlichen, wissenschaftlichen Arbeit an spannenden und innovativen Forschungsthemen in diversen Themenbereichen der hereditären Erkrankungen
• Wir fördern dabei aktiv Ihre kreative Mitgestaltung, bei der Sie stets auf die Unterstützung von engagierten und interessierten Kolleginnen und Kollegen zählen können. Nähere Informationen zu uns finden Sie auf unserer Webseite unter:
• Umfangreiche Möglichkeiten zur fachlichen und persönlichen Weiterbildung und Weiterentwicklung
• Die Ausbildung eines eigenen Forschungsschwerpunktes sowie eine angestrebte Habilitation werden ausdrücklich unterstützt
• Flexible Arbeitsorganisation im Rahmen der Anforderungen an die jeweiligen Tätigkeiten

• Leitung und Koordination der Arbeitsgruppe Bioinformatik des Instituts für Humangenetik
• Aufbau und Weiterentwicklung bioinformatischer Pipelines für die Analyse von Genom-, Exom- und RNA-Daten
• Etablierung und Pflege interner diagnostischer Plattformen und klinischer Entscheidungsunterstützungssysteme zur Variantenevaluierung sowie Integration externer Ressourcen
• Erstellung geeigneter Dokumentation zur Akkreditierung und Zertifizierung von Systemen und Begleitung des Akkreditierungs- und Zertifizierungsprozesses
• Konzeption und Implementierung innovativer Strategien zur Variantendetektion und -filterung (z. B. strukturelle Varianten, Expansionen)
• Entwicklung neuer bioinformatischer Pipelines für Forschungsanalysen (z.B. miRNA-seq, scRNA-seq, CUT&Tag, greenCUT&RUN, ChIP-seq, CLIP-seq usw.)
• Mitwirken an Projekten in den Forschungsschwerpunkten des Instituts
• Einwerbung von Drittmitteln.

• Abgeschlossenes Studium im Bereich Mathematik, Physik oder Informatik (Master/Diplom)
• Promotion im Bereich Genetik oder Humangenetik
• Langjährige, umfassende Erfahrung in der bioinformatischen Analyse von NGS-Daten, davon mehrjährige Erfahrung im diagnostischen Kontext
• Umfangreiche Erfahrung in der bioinformatischen Analyse humaner genomischer, exomischer und transkriptomischer Daten zu wissenschaftlichen und diagnostischen Zwecken
• Erfahrung mit Long-Read-Sequenzierungstechnologien
• Erfahrung in der Entwicklung und Implementierung bioinformatischer Pipelines für High-Performance-Computing-Umgebungen
• Erfahrung in der Entwicklung von Web-Plattformen sowie in der Definition von Evaluierungskriterien für humangenomische Diagnostikdaten
• Verständnis der Bewertungsprozesse humangenetischer Daten, einschließlich Erfahrung in der Variantenevaluierung sowie in der Beurteilung von Qualitätsparametern der Analyse und Sequenzierung – auch im diagnostischen Kontext Erfahrung im Bereich der akkreditierten genomischen Diagnostik, einschließlich Dokumentation, ISO-15189-Konformität, Audits und Ringversuchen
• Mehrjährige Erfahrung als Teamleitung oder in einer Führungsposition ist von Vorteil
• Erfolgreiche Einwerbung von Drittmitteln
• Erfahrung in der Beschaffung von IT-Infrastrukturen oder Laborgeräten
• Mehrjährige internationale Forschungserfahrung ist wünschenswert
• Mindestens 5 Jahre Erfahrung in der IT-Administration von Linux-Servern und Clustern
• Erfahrung in der Administration von Apache-, MySQL/MariaDB- und Open-Grid-Engine-Servern
• Sehr gute Programmierkenntnisse in Bash, Perl, Python, C/C++, R, HTML und Java
• Fundiertes Verständnis von Netzwerkarchitekturen und Sicherheitsaspekten in der Humangenetik
• Autorenschaft oder Mitautorenschaft von Publikationen in den Bereichen Bioinformatik, Genomanalyse, Patientenberichte oder allgemein humangenetische Daten
• Erfahrung als PI oder Koordinator im Rahmen kooperativer Forschungsprojekte Fähigkeit zu verantwortungsbewusstem und selbständigem Arbeiten mit hoher Eigeninitiative, Zuverlässigkeit, Engagement und Teamgeist
• Sehr gute schriftliche und mündliche Englischkenntnisse sowie gute Deutschkenntnisse in Wort und Schrift
• Sehr gute Kommunikations- und Führungsfähigkeiten

Die Universität Regensburg strebt eine Erhöhung des Frauenanteils an und fordert daher qualifizierte Frauen ausdrücklich zur Bewerbung auf. Die Universität Regensburg setzt sich besonders für die Vereinbarkeit von Familie und Beruf ein (nähere Informationen unter ). Bei im Wesentlichen gleicher Eignung werden schwerbehinderte Bewerberinnen und Bewerber bevorzugt eingestellt. Bitte weisen Sie auf eine vorliegende Schwerbehinderung ggf. bereits in der Bewerbung hin. Bitte beachten Sie, dass wir Kosten, die bei einem etwaigen Vorstellungsgespräch für Sie anfallen sollten, nicht übernehmen können.