Data Management Coordinator

vor 2 Wochen


Heidelberg, Deutschland European Molecular Biology Laboratory Vollzeit

About the job

The Data Science Centre, launched in February 2022 to promote cutting-edge research and services in Data Science across all of EMBL, is looking for a bioinformatician, computational biologist or computer scientist as a Data Management Coordinator. The Data Science Centre will ensure that biological research data at our multi-site organisation are expertly processed, integrated, annotated, and openly managed to support and foster EMBL’s missions.

Your role

In your role as a Data Management Coordinator, you will harmonise efforts in large-scale integrated biological data management across EMBL’s international sites, involving diverse data types such as genomic, imaging and structural biology data. The tasks include coordination of the implementation of standardised high-throughput data processing frameworks using workflow languages and containerized software in HPC and cloud computing environments. The role will involve close cooperation and identification of synergies with other partners within EMBL’s international sites, including with the EMBL IT services. You will also identify and address technical issues in supporting the needs of large-scale data generation and collection activities and contribute to the development and implementation of data science tools to enable these activities. As the Data management coordinator, reporting to the Head of Data Science of the EMBL, you will represent the EMBL Data Science Centre at national and international levels as appropriate, and participate in international networks and activities.

Responsibilities include:
- Coordinate tasks of the Data Science Centre pertaining to data management, which includes strategic planning.- Define best practices for data coordination and management and inform the development of the required technical infrastructure to support integrated and open data management, in coordination with EMBL’s IT services.- Define technical issues in supporting the needs of different data collection projects and contribute to the development of tools to enable project specific workflows.- Implement and monitor pipeline management frameworks for HPC and cloud environments.- Define best practices and supporting data/software management plans based on FAIR principles, together with the EMBL’s IT services.- Provide consultation and review services for the creation of data management plans across the organisation.- Improve bioinformatics workflows with respect to performance, robustness and reusability.- Direct supervision of staff (appr. 3-5) including at other EMBL sites.- Communicate the Centre’s work internally and to researchers in the field.- Coordination of public data services management at EMBL-HD.- Manage reporting and dissemination of work to funders and assist with development of new collaborations and grants.- Develop and deliver data management training in collaboration with internal training programmes.

You have- You should hold a higher degree (e.g., MSc or PhD) in Bioinformatics, Computational Biology, Biology or Computer Science.- Ideally you will have post-doctoral or equivalent experience in a bioinformatics service environment.- Familiarity with Perl/Python/Java/C++, workflow languages, and data manipulation in a bioinformatics environment are required.- Experience with software containerization tools like Docker, Singularity, and with workflow management tools like CWL, Nextflow, and Snakemake is desired.- Expertise in software development and cloud computing technologies e.g. S3 storage, Kubernetes will be beneficial.- Familiarity with biological data management and FAIR principles would be a strong plus.- You should be comfortable organising and delivering training to audiences large and small.

We offer:
- The chance to shape emerging scientific data infrastructure at the EMBL- Interesting, versatile workplace in an internationally competitive scientific setting- International, attractive working environment dedicated to open science- Campus with modern state-of-the-art infrastructure- Competitive salary- Possibility to work part-time, with flexible working hours and work space- Comprehensive training and development program

Salary: Grade 7 or 8, depending on individual experiences and qualification monthly basic salary from 5,100 EUR (after tax and before 12.05% EMBL social security deductions) and plus other paid benefits

Why join us

EMBL is curiosity-driven, community-oriented and international. As an inclusive, equal opportunity employer, we believe that diversity enables us to collaborate more effectively and be innovative in our approaches. We are, therefore, committed to creating an inclusive and flexible culture - one where everyone can realise their full potential and make a positive contribution to our organisation.

Enjoy lots of benefits:
- Financial incentives: Salary free of income tax, Monthly family, child and non-resident allowances, annual salary review, pension scheme, death benefit, long-ter



  • Heidelberg, Baden-Württemberg, Deutschland Heidelberg Engineering GmbH Vollzeit

    Heidelberg Engineering entwickelt, produziert und vertreibt nachhaltige Lösungen für die Augenheilkunde, die es Ärzten ermöglichen, die Patientenversorgung zu verbessern. Die eingesetzten Technologien für Bildgebung und Healthcare-IT werden ständig optimiert und weiterentwickelt. Als Technologieführer verfolgen wir einen hohen Innovationsanspruch und...


  • Heidelberg, Baden-Württemberg, Deutschland Heidelberg Engineering GmbH Vollzeit

    Über unsHeidelberg Engineering entwickelt, produziert und vertreibt nachhaltige Lösungen für die Augenheilkunde, die es Ärzten ermöglichen, die Patientenversorgung zu verbessern. Die eingesetzten Technologien für Bildgebung und Healthcare-IT werden ständig optimiert und weiterentwickelt. Als Technologieführer verfolgen wir einen hohen...


  • Heidelberg, Deutschland sovanta AG Vollzeit

    **Die sovanta AG optimiert die Nutzung von SAP mit Hilfe von Softwareentwicklung, UX-Design und künstlicher Intelligenz.** Als Operations Coordinator* stellst du den stabilen Betrieb unserer Cloud-Apps auf der SAP Business Technology Platform (BTP) sicher. Du kümmerst dich um das rechtzeitige und qualitativ hochwertige Störungsmanagement und führst...


  • Heidelberg, Deutschland sovanta AG Vollzeit

    **Die sovanta AG optimiert die Nutzung von SAP mit Hilfe von Softwareentwicklung, UX-Design und künstlicher Intelligenz.** Als Operations Coordinator* stellst du den stabilen Betrieb unserer Cloud-Apps auf der SAP Business Technology Platform (BTP) sicher. Du kümmerst dich um das rechtzeitige und qualitativ hochwertige Störungsmanagement und führst...

  • Research Assistant

    Vor 2 Tagen


    Heidelberg, Deutschland Universitätsklinikum Heidelberg Vollzeit

    wanted at the **Department of Infectious Disease and Tropical Medicine** for work in a tick-borne diseases project. - In Germany, lyme borreliosis (LB) and tick-borne encephalitis (TBE) stand out as the two most prevalent vector-borne diseases transmitted by Ixodes ricinus ticks. In this study, we will establish a survey platform to investigate knowledge,...

  • Logistics Coordinator

    vor 2 Wochen


    Heidelberg, Deutschland Reckitt Vollzeit

    Want to do things your way? As Logistics Coordinator (M/F/d), Hygiene - temporary for 1 year, you’ll have the freedom to get our supply operations running smoothly. And you'll do it your way. **Logistics Coordinator (M/F/d), Hygiene - temporary for 1 year** **Heidelberg, Baden-Wuerttemberg** **Competitive Salary & excellent benefits package** Joining a...


  • Heidelberg, Deutschland sovanta AG Vollzeit

    **Die sovanta AG optimiert die Nutzung von SAP mit Hilfe von Softwareentwicklung, UX-Design und künstlicher Intelligenz.** Als Operations Coordinator* stellst du den stabilen Betrieb unserer Cloud-Apps auf der SAP Business Technology Platform (BTP) sicher. Du kümmerst dich um das rechtzeitige und qualitativ hochwertige Störungsmanagement und führst...


  • Heidelberg, Deutschland sovanta AG Vollzeit

    **Die sovanta AG optimiert die Nutzung von SAP mit Hilfe von Softwareentwicklung, UX-Design und künstlicher Intelligenz.** Als Operations Coordinator* stellst du den stabilen Betrieb unserer Cloud-Apps auf der SAP Business Technology Platform (BTP) sicher. Du kümmerst dich um das rechtzeitige und qualitativ hochwertige Störungsmanagement und führst...

  • Housekeeping Coordinator

    vor 18 Stunden


    Heidelberg, Deutschland Marriott International, Inc Vollzeit

    **Additional Information** **Job Number**24207136 **Job Category**Housekeeping & Laundry **Location**Heidelberg Marriott Hotel, Vangerowstrasse 16, Heidelberg, Baden-Wurttemberg, Germany, 69115 **Schedule**Full Time **Located Remotely?**N **Position Type** Non-Management **HOUSEKEEPING COORDINATOR (m/w/d)** Heidelberg Marriott Hotel **_ Begin. Belong....


  • Heidelberg, Baden-Württemberg, Deutschland NTT DATA Vollzeit

    SAP Security Architect (w/m/d) In Voll- oder Teilzeit Empowering You – to break new ground Als NTT DATA Business Solutions sind wir mehr als nur ein Unternehmen – wir sind ein Team von innovativen und leidenschaftlichen Menschen, die sich darauf spezialisiert haben, wertschöpfende SAP-Lösungen zu schaffen und unsere Kund:innen auf...

  • Housekeeping Coordinator

    vor 18 Stunden


    Heidelberg, Deutschland Marriott International, Inc Vollzeit

    **Additional Information** **Job Number**24207136 **Job Category**Housekeeping & Laundry **Location**Heidelberg Marriott Hotel, Vangerowstrasse 16, Heidelberg, Baden-Wurttemberg, Germany, 69115 **Schedule**Full Time **Located Remotely?**N **Position Type** Non-Management **HOUSEKEEPING COORDINATOR (M/F/d)** Heidelberg Marriott Hotel **Begin. Belong....

  • Revenue Coordinator

    Vor 6 Tagen


    Heidelberg, Deutschland Leonardo Heidelberg City Center Vollzeit

    **Über uns**: Leonardo Hotels ist für die Zukunft als langfristig sicherer Arbeitgeber gut aufgestellt und auf der Suche nach Persönlichkeiten! Unser Motto **BE YOURSELF** leben wir. Konformität, strikte Vorschriften und starre Regeln sind bei uns längst Geschichte. Was bei uns zählt ist Deine Persönlichkeit. Niemand muss sich für uns verstecken oder...


  • Heidelberg, Baden-Württemberg, Deutschland NTT DATA Vollzeit

    SAP Security Architect (w/m/d) In Voll- oder Teilzeit Empowering You – to break new ground Als NTT DATA Business Solutions sind wir mehr als nur ein Unternehmen – wir sind ein Team von innovativen und leidenschaftlichen Menschen, die sich darauf spezialisiert haben, wertschöpfende SAP-Lösungen zu schaffen und unsere Kund:innen auf...


  • Heidelberg, Deutschland Reckitt Vollzeit

    **Project Coordinator Brand Marketing - Talentpool (m/w/d)** **Heidelberg**, **Baden-Wuerttemberg** **Competitive Salary & excellent benefits package** We are proactivly looking for talents as Project Coordinator Brand Marketing (m/w/d) for the near future to join our team. With complete involvement from the first day, you’ll be part of a team that...

  • Sales Support Specialist

    vor 16 Stunden


    Heidelberg, Deutschland ABB Vollzeit

    **Sales Support Specialist - Master Data (M/F/d)**: **Take your next career step at ABB with a global team that is energizing the transformation of society and industry to achieve a more productive, sustainable future. At ABB, we have the clear goal of driving diversity and inclusion across all dimensions: gender, LGBTQ+, abilities, ethnicity and...


  • Heidelberg, Deutschland Springer Nature Vollzeit

    **Location: Heidelberg '“ Hybrid working model** **Fix-term contract, 12 months** **About Springer Nature Group           Â** Springer Nature opens the doors to discovery for researchers, educators, clinicians and other professionals. Every day, around the globe, our imprints, books, journals, platforms and technology solutions...

  • Data Scientist

    Vor 5 Tagen


    Heidelberg, Deutschland HMS Analytical Software Vollzeit

    **Data Scientist (mwd)**: **Berufseinsteiger, Berufserfahrene** *** *** **Heidelberg, Berlin, Remote** *** *** **Data Scientist** *** *** **Vollzeit, Teilzeit (mind. 80%)** *** *** **Ihre** Aufgaben**: - Als Data Scientist (mwd) erarbeiten Sie im Dialog mit unseren Kunden innovative Lösungen zur anspruchsvollen Datenanalyse.- Sie entwickeln und...


  • Heidelberg, Deutschland Marriott International, Inc Vollzeit

    **Stellenangebotsnummer** 22188269 **Tätigkeitskategorie** Sales & Marketing **Standort** Heidelberg Marriott Hotel, Vangerowstrasse 16, Heidelberg, Baden-Wurttemberg, Germany AUF KARTE ANZEIGEN **Beschäftigungsart** Full-Time **Nicht vor Ort?** N **Umzug?** N **Stellenart** Non-Management **EVENT SALES COORDINATOR (M/W/D)** Heidelberg Marriott...


  • Heidelberg, Deutschland Reckitt Vollzeit

    **Project Coordinator Brand Marketing - Talentpool (m/w/d)** **Heidelberg, Baden-Wuerttemberg** **Competitive Salary & excellent benefits package** We are proactivly looking for talents as Project Coordinator Brand Marketing (m/w/d) for the near future to join our team. With complete involvement from the first day, you’ll be part of a team that bring...


  • Heidelberg, Baden-Württemberg, Deutschland NTT DATA Vollzeit

    Marketing-Manager (m/w/d) Global Event In Voll- oder Teilzeit, befristet bis min. ..7 im Rahmen einer Elternzeitvertretung  You – to break new ground Als NTT DATA Business Solutions sind wir mehr als nur ein Unternehmen – wir sind ein Team von innovativen und leidenschaftlichen Menschen, die sich darauf spezialisiert haben, wertschöpfende...