Phd - Machine Learning

vor 1 Woche

Frankfurt am Main, Deutschland Universitätsklinikum Frankfurt Vollzeit

(We are targeting applicants of all genders)
**Full time | limited to 3 years with possibility of extension | Announcement number: 987-2024**

The **Edinger Institute**is a German research institution and neuropathological diagnostic section at the University Hospital Frankfurt am Main. We are part of an excellent scientific community in Frankfurt including the Mildred Scheel Career Center (MSNZ), the Univeristy Cancer Center (UCT Frankfurt-Marburg), the German Consortium for Translational Cancer Research (DKTK) and the Frankfurt Cancer Institute (FCI). The Biobank and Immunomonitoring-Platform of the FCI is located at the Edinger Institute and offer optimal conditions for tissue-based research. The **AG Molecular and Computational Neuropathology**uses machine and deep learning as well as genome-wide molecular analysis methods in tumor specimens and liquid biopsies to develop new diagnostic tools and to establish novel prognostic and predictive biomarkers for neurooncological patients.

**About the project**

For an insight into the University Hospital Frankfurt, click here.

**Your role**
- Data preparation and training of convolutional neural networks to improve cancer cell detection and origin prediction
- Comparison and selection of cell segmentation algorithms and optimization for cerebrospinal fluid samples
- Development of interactive visualization and reporting tools for diagnostics and collaborative research projects
- Implementation of explainable AI methods and confidence scores to increase the interpretability of classification results for diagnostic use
- Establishment of a diagnostic workflow for deep learning-based cerebrospinal fluid cell analysis for a clinical evaluation period (12 months) in parallel to routine diagnostics

**Who you are**
- You have successfully completed a Master’s degree in a related field such as bioinfromatics, computer science or physics and are pursuing a publication-based doctorate.
- Proven programming experience in languages such as Python, R, or C++, frameworks such as PyTorch, TensorFlow, or NumPy, and version control systems like Git
- Excellent communication skills and ability to collaborate
- Proficiency in English, good knowledge of German (min. B2)
- Due to legal regulations, valid proof of measles immunity / measles vaccination is required

**What we offer**
- **Work environment**:Working in an interdisciplinary, young research team.
- **Collective agreement**: In addition to an attractive salary based on a collective agreement with an annual special payment, you benefit from long-term security through company pension schemes
- **Mobility**: Free public transport in all Hessen (Free State Ticket Hessen)
- **Campus**: Our attractive university hospital campus offers a modern cafeteria, various cafes, and opportunities to rest in numerous green spaces. A walk on the riverside of the Main offers relaxation during breaks
- **Work-Life-Balance**: Part-time employment is possible, we offer childcare in our daycare center (if you have any questions, please contact UKF-Familienservice), child care during holidays
- **Health Promotion**: Benefit from our attractive health offers. We offer regular online and face-to-face courses on nutrition, relaxation, sports and exercise.
- **Professional development**: Internal and external training for your professional development
- **Any questions?** Many answers can be found in our FAQs for new employees. If you have any further questions, please do not hesitate to contact us.

Women are underrepresented in these positions at the University Hospital Frankfurt. Applications from women are therefore particularly welcome. Disabled applicants are preferred if they have the same personal and professional qualifications.

**Join our team

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