Universitätsklinikum Frankfurt | PhD
Vor 3 Tagen
"Knowledge becomes health" - we are filling this motto with life every day, developing new ideas and improv-ing old-established knowledge. The University Hospital Frankfurt has existed since 1914. Our around 8,500 employees contribute with their skills and knowledge to the 33 specialist clinics, theoretical clinical institutes, and administrative departments. The close connection of health care with research and teaching, as well as a climate of collegiality, internationality, and cross-professional cooperation characterize the university hospital.
- (We are targeting applicants of all genders)
- Full time | limited to 3 years with possibility of extension | Announcement number: 987-2024
The Edinger Institute is a German research institution and neuropathological diagnostic section at the University Hospital Frankfurt am Main. We are part of an excellent scientific community in Frankfurt including the Mildred Scheel Career Center (MSNZ), the Univeristy Cancer Center (UCT Frankfurt-Marburg), the German Consortium for Translational Cancer Research (DKTK) and the Frankfurt Cancer Institute (FCI). The Biobank and Immunomonitoring-Platform of the FCI is located at the Edinger Institute and offer optimal conditions for tissue-based research. The AG Molecular and Computational Neuropathology uses machine and deep learning as well as genome-wide molecular analysis methods in tumor specimens and liquid biopsies to develop new diagnostic tools and to establish novel prognostic and predictive biomarkers for neurooncological patients.
We are recruting a PhD student for a DFG-funded research project focused on the automated detection and classification of tumor cells in cerebrospinal fluid samples by deep learning models. The aim is to develop a fully digital workflow and clinical-grade deep learning tool to tranform the current practice in neuropathological institutes of manual cell differentiation and counting of cerebrospinal fluid samples using a microscope. The thesis will build on a previously published algorithm (PMID: 36519297; ) and use a new, multicentric, well-annotated cancer cell dataset to improve automated cell segmentation, cancer cell detection and tumor origin prediction.
For an insight into the University Hospital Frankfurt, click here .
Data preparation and training of convolutional neural networks to improve cancer cell detection and origin prediction
Comparison and selection of cell segmentation algorithms and optimization for cerebrospinal fluid samples
Development of interactive visualization and reporting tools for diagnostics and collaborative research projects
Implementation of explainable AI methods and confidence scores to increase the interpretability of classification results for diagnostic use
Establishment of a diagnostic workflow for deep learning-based cerebrospinal fluid cell analysis for a clinical evaluation period (12 months) in parallel to routine diagnostics
You have successfully completed a Master’s degree in a related field such as bioinfromatics, computer science or physics and are pursuing a publication-based doctorate.
Proven programming experience in languages such as Python, R, or C++, frameworks such as PyTorch, TensorFlow, or NumPy, and version control systems like Git
Excellent communication skills and ability to collaborate
Proficiency in English, good knowledge of German (min. B2)
Due to legal regulations, valid proof of measles immunity / measles vaccination is required
Work environment: Working in an interdisciplinary, young research team.
Collective agreement: In addition to an attractive salary based on a collective agreement with an annual special payment, you benefit from long-term security through company pension schemes
Mobility: Free public transport in all Hessen (Free State Ticket Hessen)
Campus: Our attractive university hospital campus offers a modern cafeteria, various cafes, and opportunities to rest in numerous green spaces. A walk on the riverside of the Main offers relaxation during breaks
Work-Life-Balance: Part-time employment is possible, we offer childcare in our daycare center (if you have any questions, please contact UKF-Familienservice), child care during holidays
Health Promotion: Benefit from our attractive health offers. We offer regular online and face-to-face courses on nutrition, relaxation, sports and exercise.
Professional development: Internal and external training for your professional development
Any questions? Many answers can be found in our FAQs for new employees. If you have any further questions, please do not hesitate to contact us.
Women are underrepresented in these positions at the University Hospital Frankfurt. Applications from women are therefore particularly welcome. Disabled applicants are preferred if they have the same personal and professional qualifications.
Use the time until January 06, 2025 to apply. Please submit your online application including a possible starting date and your salary expectations. For further information regarding the position and project, please contact PD Dr. Leonille Schweizer via 069 / or via .
Universitätsmedizin Frankfurt | Recruiting Team | Theodor-Stern-Kai 7 | 60590 Frankfurt am Main | Bitte reichen Sie Ihre Bewerbung ausschließlich über den Button „Online bewerben“ ein. Rückfragen können Sie gerne an richten. Bitte beachten Sie, dass keine Unterlagen zurückgeschickt werden. | Folgen Sie uns auf Instagram ( @unimedizin-ffm ); XING , LinkedIn .
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Universitätsklinikum Frankfurt |
Vor 3 Tagen
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Laboranalysikerin im Universitätsklinikum Frankfurt
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Frankfurt am Main, Hessen, Deutschland Universitätsklinikum Frankfurt VollzeitBeschreibung der PositionWir suchen eine Laboranalysikerin, die in unserem Zentrallabor im Universitätsklinikum Frankfurt arbeiten möchte. Die Position ist in Vollzeit oder Teilzeit besetzt und bietet eine Vielzahl von Möglichkeiten für Weiterbildung und Karriereentwicklung.Als Laboranalysikerin werden Sie an der Durchführung klinisch-chemischer,...
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Frankfurt am Main, Hessen, Deutschland Universitätsklinikum Frankfurt VollzeitÜberblickBereits seit 1914 ist das Universitätsklinikum Frankfurt ein wichtiger Teil der medizinischen Versorgung in Frankfurt am Main.Löhne und GehälterDas Gehalt als Arbeitsmediziner*in im Universitätsklinikum Frankfurt beträgt ca. €100.000 - €120.000 pro Jahr.AufgabenbereichAls Arbeitsmediziner*in werden Sie für die Durchführung von...
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vor 4 Wochen
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Intensivmedizinische Assistenzärztin
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Frankfurt am Main, Hessen, Deutschland Universitätsklinikum Frankfurt VollzeitEinzigartige Kombination aus Flexibilität und Fachlichkeit erwartet Sie als Pflegefachkraft im Universitätsklinikum Frankfurt. Unsere rund 7.500 Beschäftigten bringen sich mit ihrem Können und Wissen an den 33 Fachkliniken, klinisch theoretischen Instituten und in den Verwaltungsbereichen ein.Sicherheit durch PlanbarkeitAls Teil unseres Flex-Pools...
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Radiologe/rin in Weiterbildung
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Frankfurt am Main, Hessen, Deutschland Universitätsklinikum Frankfurt VollzeitBewegende Ärzteschaft – Zukunft gesundes Leben!Über das Universitätsklinikum FrankfurtDas Universitätsklinikum Frankfurt ist ein Einrichtung mit Geschichte und Ausblick. Mit rund 8.500 Beschäftigten arbeiten wir an den 33 Fachkliniken, klinisch theoretischen Instituten und im Verwaltungsbereich.Unser Ziel: Eine enge Verbindung zwischen...
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Frankfurt am Main, Hessen, Deutschland Universitätsklinikum Frankfurt VollzeitWir suchen nach einer erfahrenen Fachleiterin, die unsere Tumordokumentation mit ihrem Können und Wissen weiterentwickeln möchte. Als Teil des Universitätsklinikums Frankfurt, einem führenden Kompetenzzentrum für Krebsforschung und -behandlung, haben Sie die Chance, Ihre Fähigkeiten in einem dynamischen Umfeld einzubringen.Gehen Sie von folgendem...
