Masterthesis "Merkmalsextraktion mit Auto-Encodern zur Verhaltenserkennung aus Beschleunigungsdaten"

Das Leibniz-Institut für Zoo- und Wildtierforschung im Forschungsverbund Berlin e.V. (Leibniz-IZW, FVB), Teil der Leibniz-Gemeinschaft, will die Anpassungsfähigkeit von Wildtieren im Kontext des globalen Wandels verstehen und - wo möglich – ihre Überlebensfähigkeit verbessern. Dafür untersucht es die Vielfalt der Lebenswesen, Mechanismen evolutionärer Anpassungen und Anpassungsgrenzen inklusive der Krankheiten von Wildtieren in- und außerhalb menschlicher Obhut und ihre Wechselbeziehungen mit Mensch und Umwelt in Deutschland, Europa und Übersee. Das Institut erfüllt diese Aufgabenstellung durch langfristig angelegte, anwendungsorientierte, interdisziplinäre Grundlagenforschung in Evolutionäre Ökologie, Ökologische Dynamik, Evolutionsgenetik, Wildtierkrankheiten, Reproduktionsbiologie und Reproduktionsmanagement.

In unserer Abteilung Evolutionäre Ökologie (Arbeitsgruppe Chronoökologie) vergeben wir ein Masterarbeitsprojekt zum Thema

"Merkmalsextraktion aus Zeitreihendaten mit Auto-Encodern zur (Tier-)Verhaltenserkennung aus 3D-Beschleunigungsdaten"

Aufgaben:

Im Rahmen unserer Projekte zur Analyse des Verhaltens von Wildtieren anhand von Beschleunigungsdaten sollen bei dieser Arbeit Methoden zur Merkmalsextraktion durch Autoencoder entwickelt und getestet werden. Ziel ist das Finden eines optimierten Neuronalen Netzes und die Minimierung der benötigten Anzahl von Werten im dem Latenten Vektor. Für die Arbeit steht eine umfangreiche Sammlung von 3D-Beschleunigungsdaten, mit und ohne Labels, von verschiedenen Tierarten zur Verfügung.

Voraussetzungen:

• Immatrikulation in einem naturwissenschaftlichen oder technischem Studium, idealerweise Informatik, Bioinformatik oder verwandte Studiengänge
• Interesse an ökologischen Fragestellungen
• Zuverlässigkeit, Motivation und selbstständiges wissenschaftliches Arbeiten
• Verständnis für mathematisch-technische Analyseverfahren
• Erfahrung im Umgang mit großen Datenmengen
• grundlegende Kenntnisse in Python, Maschinellem Lernen und neuronalen Netzen
• fließende Englisch- oder Deutschkenntnisse in Wort und Schrift (mind. B2)

Die Masterarbeit kann sofort begonnen werden. Es besteht die Möglichkeit ein vorbereitendes Praktikum (freiwilliges Praktikum oder Pflichtpraktikum) bei uns zu absolvieren. Eine Vergütung können wir leider nicht anbieten.

Für nähere Auskünfte stehen Ihnen die betreuende Wissenschaftlerin Dr. Anne Berger per Email (-) und telefonisch nur mittwochs zur Verfügung.

Willkommen sind Menschen gleich welchen Geschlechts, Herkunft, sexuellen Orientierung und Religion, es besteht Chancengleichheit. Schwerbehinderte werden bei gleicher Eignung bevorzugt berücksichtigt. Das IZW lebt die Prinzipien der Charta der Vielfalt und hat eine Diversitäts- und Inklusionsstrategie, ist "Total-E-Quality" zertifiziert, fördert die Gleichstellung und unterstützt aktiv die Vereinbarkeit von Beruf und Familie. Dazu gehört auch die Möglichkeit eines mit dem Team abgestimmten mobilen Arbeitens. Wir fördern Vielfalt, bitte überzeugen Sie uns mit Ihrer Qualität und Kompetenz.

Interessiert:

Dann bewerben Sie sich ausschließlich über unsere Rekrutierungsplattform unter: mit den üblichen Unterlagen:

1) Motivationsschreiben mit Angabe des gewünschten Zeitraums für die Abschlussarbeit

2) Lebenslauf

3) aktuelle Immatrikulationsbescheinigung

4) Nachweis zum Verfassen der Abschlussarbeit gemäß Studien- und Prüfungsordnung Ihrer Hochschule

5) alle relevanten Zeugnisse

Wir freuen uns auf Ihre Bewerbung

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The Leibniz Institute for Zoo and Wildlife Research (Leibniz-IZW) in the Forschungsverbund Berlin e.V. (FVB), a part of the Leibniz Association, aims to understand and, where possible, 'improve' the adaptive capacity of wild animals to cope with global change. To this end, it focuses on the diversity of lifestyles, diseases and mechanisms of evolutionary adaptation of mammals and birds, on the limits of these mechanisms in natural and anthropogenically influenced environments, and on conservation strategies that take these into account. The Institute fulfils this mission through long-term, application-oriented, interdisciplinary basic research in evolutionary ecology, ecological dynamics, evolutionary genetics, wildlife diseases, reproductive biology and reproductive management.

For our Department of Evolutionary Ecology (Chrono-ecology work group), we are offering a master's thesis project entitled:

"Feature extraction from time series data using auto-encoders for (animal) behaviour recognition from acceleration data"

Tasks:

As part of our projects analyzing wild animal behaviour using acceleration data, this work aims to develop and test methods for feature extraction using autoencoders. The goal is to find an optimized neural network and minimize the required number of values in the latent vector. An extensive collection of 3D acceleration data, with and without labels, from various animal species is available for this work.

Requirements:

• Enrollment in a natural science or technical degree program with a preference for majors such as informatics, bioinformatics, or related fields
• Interest in ecological issues
• Demonstrated reliability, motivation, and the ability to conduct independent scientific work
• Understanding of mathematical-technical analysis methods
• Foundational knowledge of Python, machine learning and neural networks
• Fluent in English or German, both written and spoken (at least B2)

The master's thesis can be started immediately. It is possible to complete a preparatory internship (voluntary or compulsory internship) with us. Unfortunately, we cannot offer any remuneration.

Enquiries or questions should be directed to the two supervisors of the master thesis Dr. Anne Berger by Email (-) or telephone (only on Wednesday:

We welcome applications regardless of gender, origin, sexual orientation and religion. Disabled persons will be given preferential consideration in case of equal suitability. The IZW lives the principles enshrined by the German "Charta of Diversity" ("Charta der Vielfalt"), has a diversity and inclusion strategy, is "Total-E-Quality" certified, promotes equality and actively supports a work-life balance. We promote diversity, so please convince us with your quality and competence.

Interested:

Then please apply and submit your complete and informative application via our recruitment platform at including:

1) Letter of motivation stating the desired time period for the thesis

2) Resume

3) Current certificate of enrolment

4) Proof of thesis writing in accordance with the study and examination regulations of your university

5) All relevant certificates

We look forward to receiving your application