Wissenschaftlicher Mitarbeiterin

Die Johann Wolfgang Goethe-Universität Frankfurt am Main ist mit etwa Studierenden und rund 5.800 Beschäftigten eine der größten Hochschulen in Deutschland. 1914 von Frankfurter Bürgern gegründet und seit 2008 wieder in der Rechtsform einer Stiftung verfügt die Goethe-Universität über ein hohes Maß an Autonomie, fachlicher Vielfalt und Innovationsfähigkeit. Als Volluniversität bietet die Goethe-Universität an derzeit fünf Standorten 155 Studiengänge in 16 Fachbereichen an, besitzt eine herausragende Forschungs- und Drittmittelstärke und ist in vielfältigen Interaktionen durch ihre Wissenschaftler*innen eng mit der Gesellschaft verknüpft. Darüber hinaus ist die Goethe-Universität innerhalb des Verbundes der Rhein-Main-Universitäten (RMU) eingebettet.

In der Abteilung Angewandte Bioinformatik am Institut für Zellbiologie und Neurowissenschaft des Fachbereichs Biowissenschaften der Goethe-Universität Frankfurt am Main ist zum nächstmöglichen Zeitpunkt die Stelle für eine*n

Wissenschaftliche*n Mitarbeiter*in (m/w/d)

(E 13 TV-G-U, 65%-Teilzeit)

befristet für die Dauer von drei Jahren im von der Deutschen Forschungsgemeinschaft (DFG) geförderten Projekt: "Genetische und genomische Strukturevolution als Grundlage für Veränderungen in der Ernährungsökologie bei Hemipteren" im Rahmen des Schwerpunktprogramms "Die Genomischen Grundlagen Evolutionärer Innovationen (GEvol)" zu besetzen. Die Eingruppierung richtet sich nach den Tätigkeitsmerkmalen des für die Goethe-Universität geltenden Tarifvertrages (TV-G-U).

Projektbeschreibung:

Seit Jahrzehnten werden Fragen aus allen Bereichen der Biologie im Insektenmodell bearbeitet. Moderne bioinformatische Ansätze ermöglichen es, aus den immer umfassender werdenden genomischen Ressourcen, spezifische Muster der Genomorganisation und Genregulation auf einzelnen evolutionären Linien herauszuarbeiteten. Diese bilden die Grundlage für ein zunehmend tiefes Verständnis, wie physiologische Merkmale einzelner Arten im Zuge der Evolution entstehen. In diesem Projekt wollen wir genomische und genetische Vergleiche anwenden, um die molekularen Grundlagen der Ernährungsspezialisierung bei Hemipteren (Blattläusen, Psylliden und Wanzen) zu untersuchen. Wir fokussieren uns auf Veränderungen in der koordinierten Regulation großer Gen-Netzwerke, die Erweiterungen von Genfamilien, die funktionelle Diversifizierung über alternatives Spleißen und auf Beiträge mikrobieller Symbionten. Die bioinformatischen Ergebnisse aus diesem Projekt werden über eine enge Kooperation mit Kristen Panfilio (AK für Molekulare Genetik, Universität Hohenheim) mit molekularen und organismischen Daten verschränkt. Gemeinsam wollen wir untersuchen, wie Genom- und Genexpressions-Dynamiken funktionelle Ernährungsstrategien in Vertretern der Hemipteren bestimmen. Das Projekt ist Teil des DFG Schwerpunktprogramms "Die Genomischen Grundlagen Evolutionärer Innovationen (Gevol)" und ist damit in ein interdisziplinäres und lebendiges wissenschaftliches Netzwerk eingebettet, das Funktion und Evolution von Insekten aus verschiedensten Perspektiven beleuchtet.

Zu den projektbezogenen Aufgaben und Zielen gehören insbesondere:

• Design und Aufbau einer Web-basierten Plattform für das Management und die interaktive Nutzung und Analyse von Insekten-Genomen
• Entwicklung und Implementierung neuer Ansätze zur Evaluierung der Qualität von Genom-Assemblies
• Weiterentwicklung von bioinformatischen Methoden zur Analyse des Einflusses von alternativem Spleißens auf die funktionelle Diversifizierung eines Proteoms
• Erstellung von Genotyp-Phänotyp Karten um zu verstehen, wie sich Hemipteren an neue Nahrungsquellen anpassen
• evolutionäre Analyse Insekten Gen- und Proteinsets im Kontext der Anpassung an neue Nahrungsquellen
• Software-Entwicklung im Bereich der Biosequenz-Informatik mit Schwerpunkt auf der funktionellen Diversifizierung von Proteinen über alternatives Spleißen
• Mitarbeit in der Analyse nicht-kodierender funktioneller Bereiche in Insektengenomen
• Modellierung von Proteinstrukturen und Struktur-Ensembles
• Unterstützung in der wissenschaftlichen Ausbildung im Bereich der Biodiversitätsgenomik
• die Anfertigung Ihrer Dissertation

Einstellungsvoraussetzungen:

• mindestens ein wissenschaftlicher Hochschulabschluss (MSc. oder vergleichbar) in Bioinformatik, Informatik, Molekular-/Systembiologie, Mathematik/Statistik oder in einem verwandten Feld
• sehr gute Programmierkenntnisse in mindestens einer der folgenden Sprachen: Javascript, Perl, Python, C++ oder R
• Erfahrung in der Analyse biologischer Sequenzen vor einem evolutionären und/oder funktionellen Hintergrund
• starke kommunikative Fähigkeiten, Teamfähigkeit sowie sehr gute Englischkenntnis in Wort und Schrift

Der Arbeitskreis für Angewandte Bioinformatik beschäftigt sich mit Forschungsthemen rund um die Evolution von biologischen Sequenzen und deren Funktion. Hierbei decken wir ein breites Spektrum ab, das von der Modellierung von Sequenzevolution, über die Entwicklung von Algorithmen und Methoden in der Homologen-Suche und die Rekonstruktion von Sequenz- und Speziesbäumen bis hin zu vergleichenden Genomanalysen und dem funktionellen Annotationstransfer zwischen Modell- und nicht-Modell-Organismen reicht. Unser übergeordnetes Ziel ist es, die Evolution von funktionellen Protein-Interaktionsnetzwerken zu rekonstruieren und mit den Charakteristika der heute existierenden Arten zu verbinden. Wir führen diese Analysen anhand von Daten unterschiedlicher Organismengruppen durch, die sich aus allen drei Domänen des Lebens (Bakterien, Archaea, Eukaryoten) rekrutieren.

Weitere Informationen über unsere Gruppe finden Sie unter

Die Goethe-Universität setzt sich aktiv ein für Chancengerechtigkeit, Vielfalt und Inklusion. Sie begrüßt besonders Bewerbungen von qualifizierten Persons of Color und legt großen Wert auf die familienfreundliche Gestaltung universitärer Arbeitszusammenhänge. Personen mit einer Schwerbehinderung oder diesen Gleichgestellte werden bei gleicher Eignung bevorzugt berücksichtigt. Sind Frauen in dem Fachbereich/der zentralen Einrichtung unterrepräsentiert, werden sie bei gleicher Qualifikation bevorzugt berücksichtigt.

Ihre Bewerbung mit den üblichen Unterlagen (Anschreiben, Lebenslauf und Zeugnisse) richten Sie bitte bis zum in elektronischer Form (zusammengefasst in einer PDF-Datei mit max. 8 MB) an Prof. Dr. Ingo Ebersberger, Goethe-Universität Frankfurt am Main, Abteilung für Angewandte Bioinformatik (FB 15), Max-von-Laue-Str. 13, 60438 Frankfurt am Main.

Kosten, die Ihnen im Rahmen des Bewerbungsverfahrens entstehen, können leider nicht von der Goethe-Universität erstattet werden.

Art der Stelle: Teilzeit

Gehalt: 1.500,00€ ,00€ pro Monat

Erwartete Arbeitsstunden: 26 pro Woche

Leistungen:

• Betriebliche Weiterbildung
• Flexible Arbeitszeiten
• Homeoffice-Möglichkeit
• Kostenloser Parkplatz

Arbeitsort: Zum Teil im Homeoffice in 60438 Frankfurt am Main