Bioinformatiker/ Bioinformatikerin

Stellenbeschreibung:

Bioinformatiker/ Bioinformatikerin (m/w/d)

Genetische Forschung

Die Stelle ist zum in Voll- oder Teilzeitbeschäftigung mit mindestens 30 Wochenstunden bis zum befristet zu besetzen. Die Vergütung erfolgt nach den Eingruppierungsvorschriften des Tarifvertrages für den öffentlichen Dienst (TV-L) und ist bei Vorliegen der persönlichen Voraussetzungen in die
Entgeltgruppe 13
möglich.

Braucht Ihr ganzes Können - Ihr Aufgabengebiet:

• Entwicklung, Etablierung und Validierung bioinformatischer Softwarelösungen
  sowie
  Betreuung und Weiterentwicklung bestehender Datenflüsse und Analyse-Pipelines
  zur Auswertung komplexer genetischer Daten
• Integration und Verknüpfung großer biologischer Datenbanken
  (z. B. über API-Schnittstellen) zur effizienten Nutzung multidimensionaler Datensätze
• Eigenständige Analyse von Sequenzierdaten
  unterschiedlicher Plattformen (Illumina, Element Biosciences, Oxford Nanopore, Pacific Biosciences)
• Entwicklung und Anwendung von Methoden des maschinellen Lernens
  zur Interpretation genetischer, phänotypischer und funktionaler Daten (z. B. Pathway-Analysen)
• Konzeption, Automatisierung und Validierung bioinformatischer Workflows
  zur Analyse von Next-Generation-Sequencing-Daten
• Verfassen wissenschaftlicher Publikationen
  sowie
  aktive Mitarbeit an Verbundpublikationen und Drittmittelanträgen
• Engagierte Zusammenarbeit mit interdisziplinären Partnern
  und
  eigenverantwortliches Projektmanagement
  im Rahmen genetischer Diagnostik gemäß den Vorgaben des Qualitätsmanagement-Handbuchs

Passt perfekt - Ihr Profil:

• abgeschlossenes wissenschaftliches Hochschulstudium in Informatik, Biologie, Bioinformatik, Medizininformatik oder einer verwandten Disziplin
• Promotion erwünscht
• Erfahrung in der Analyse von Sequenzierdaten
  (z. B. Targeted Resequencing, RNA-Seq, DNA-Seq) und idealerweise
  Kenntnisse in Methoden des Maschinellen Lernens
• Programmierkenntnisse
  in mindestens einer Sprache (z. B. Python, R, Java, Perl) sowie Bereitschaft zur
  Einarbeitung in Python
• Grundkenntnisse in Genetik
  und Erfahrung mit
  Pipeline- und Workflow-Tools
  (z. B. Snakemake, Nextflow)
• Sicherer Umgang mit Linux- und HPC-Umgebungen
  ; Kenntnisse in
  containerbasierten Virtualisierungen
  (Docker, Singularity) und
  virtuellen Environments
  (conda, mamba)
• Erfahrung mit 
  Versionsverwaltungssystemen
  (GitHub, GitLab)
• Grundkenntnisse in Datenschutz und Datensicherheit
  bei genetischen Daten; Wissen über
  Medizininformatik-Standards
  (z. B. FHIR) ist von Vorteil
• Deutschkenntnisse sind nicht zwingend erforderlich, gute Englischkenntnisse sind Voraussetzung

Überzeugt auf ganzer Linie - Unser Angebot:

• attraktive Vergütung nach Tarifvertrag
• Vereinbarung von flexiblen Arbeitszeiten, um die Verbindung von Familie und Beruf in die Realität umzusetzen
• Berufsorientierten Fort- und Weiterbildungen mit individueller Planung Ihrer beruflichen Karriere und damit die Entwicklung eines zukunftsorientierten, individuellen beruflichen Profils
• Nutzung von betrieblichen Präventions- und Fitnessangeboten in unserem Gesundheitszentrum Carus Vital inkl. Teilnahme an Teamevents, Vorträgen, Kursen und Seminaren
• Betreuung Ihrer Kinder durch Partnerschaften mit Kindereinrichtungen in der Nähe des Klinikums
• Vorsorge für die Zeit nach der aktiven Berufstätigkeit in Form einer betrieblich unterstützten Altersvorsorge
• Nutzung von Bikeleasing und die Möglichkeit des Job-Tickets
• Unterstützungsangebote für alle Lebensbereiche durch unser Familienbüro und die Mitarbeiterberatung
• Weitere Vorteile durch unsere Mitarbeitenden-Benefits

Profilbeschreibung:

• abgeschlossenes wissenschaftliches Hochschulstudium in Informatik, Biologie, Bioinformatik, Medizininformatik oder einer verwandten Disziplin
• Promotion erwünscht
• Erfahrung in der Analyse von Sequenzierdaten
   (z. B. Targeted Resequencing, RNA-Seq, DNA-Seq) und idealerweise 
  Kenntnisse in Methoden des Maschinellen Lernens
• Programmierkenntnisse
   in mindestens einer Sprache (z. B. Python, R, Java, Perl) sowie Bereitschaft zur 
  Einarbeitung in Python
• Grundkenntnisse in Genetik
   und Erfahrung mit 
  Pipeline- und Workflow-Tools
   (z. B. Snakemake, Nextflow)
• Sicherer Umgang mit Linux- und HPC-Umgebungen
  ; Kenntnisse in 
  containerbasierten Virtualisierungen
   (Docker, Singularity) und 
  virtuellen Environments
   (conda, mamba)
• Erfahrung mit 
  Versionsverwaltungssystemen
   (GitHub, GitLab)
• Grundkenntnisse in Datenschutz und Datensicherheit
   bei genetischen Daten; Wissen über 
  Medizininformatik-Standards
   (z. B. FHIR) ist von Vorteil
• Deutschkenntnisse sind nicht zwingend erforderlich, gute Englischkenntnisse sind Voraussetzung

Wir bieten:

• attraktive Vergütung nach Tarifvertrag
• Vereinbarung von flexiblen Arbeitszeiten, um die Verbindung von Familie und Beruf in die Realität umzusetzen
• Berufsorientierten Fort- und Weiterbildungen mit individueller Planung Ihrer beruflichen Karriere und damit die Entwicklung eines zukunftsorientierten, individuellen beruflichen Profils
• Nutzung von betrieblichen Präventions- und Fitnessangeboten in unserem Gesundheitszentrum Carus Vital inkl. Teilnahme an Teamevents, Vorträgen, Kursen und Seminaren
• Betreuung Ihrer Kinder durch Partnerschaften mit Kindereinrichtungen in der Nähe des Klinikums
• Vorsorge für die Zeit nach der aktiven Berufstätigkeit in Form einer betrieblich unterstützten Altersvorsorge
• Nutzung von Bikeleasing und die Möglichkeit des Job-Tickets
• Unterstützungsangebote für alle Lebensbereiche durch unser Familienbüro und die Mitarbeiterberatung
• Weitere Vorteile durch unsere Mitarbeitenden-Benefits