Masterarbeit

Vor 7 Tagen


Hamburg, Hamburg, Deutschland Institute of Bioprocess and Biosystems Engineering - TUHH Vollzeit

Master Thesis Project

Characterization of an
Escherichia coli
reporter strain for monitoring protein damage and metabolic burden on the post-translational level in bioprocesses

Introduction

Metabolic burden is a central challenge in industrial biotechnology. Engineering microbial hosts for protein production or other biotechnological applications often disrupts the natural allocation of cellular resources, leading to physiological stress. Cells under such burden frequently exhibit reduced growth, impaired protein synthesis, misfolded proteins, inclusion body formation, and genetic instability. Environmental fluctuations in bioprocesses can further exacerbate these effects, resulting in heterogeneous cell populations and inconsistent product yields.

This Master's thesis focuses on the characterization of a potential fluorescence reporter system for metabolic burden on post-translational level, with a particular emphasis on protein damage as a measurable indicator of cellular stress. The goal of this work is to deepen the understanding of how metabolic burden arises in bioprocesses and to establish approaches for monitoring and mitigating stress associated with protein overproduction

Requirements

  • Master Student enrolled in Bioprocess Engineering, Biotechnology, Molecular Biology, or a related field
  • Practical experience in microbiology or molecular biology techniques, ideally including cultivation of microorganisms
  • Basic knowledge of flow cytometry and protein analysis is advantageous
  • Motivated, precise, and independent working style, with strong teamwork and communication skills

Start

As soon as possible

Duration

6 month full-time

Tasks

·    Perform experiments in different bioreactor types and under varying growth conditions

·    Application of flow cytometry for characterization of populations

·    Verification of protein damage (incl. enzyme activity assay, SDS-PAGE)

·    Experimental design and analysis of data

·    Optional: Modification of strains using genetic engineering techniques

Contact

Julia von Irmer -



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