Doktorand - Bioinformatiker (M/F/d)

Wir suchen zum nächstmöglichen Zeitpunkt einen

Doktorand - Bioinformatiker (M/F/d)

Die Stelle ist auf 3 Jahre befristet.

Das Forschungszentrum Borstel ist das Lungenzentrum in der Leibniz Gemeinschaft. Wir sind ein international agierendes, von Bund und Ländern finanziertes Wissenschaftsunternehmen. Unsere zentrale Aufgabe ist die Grundlagen
- und translationale Forschung auf dem Gebiet der Atemwegserkrankungen. Wir betreiben umfangreiche Labor
- und Forschungsinfrastrukturen. Akademisch sind wir mit den benachbarten Universitäten und klinisch mit dem Universitätsklinikum Schleswig-Holstein eng verbunden. Wir haben ein Ziel: Bestehende Methoden zur Erkennung, Vermeidung und Behandlung von Lungenerkrankungen zu verbessern und neue, innovative Therapieansätze zu entwickeln.

Die Gruppe Datenwissenschaft des Zentrums führt Bioinformatik-Forschung an Daten durch, die durch neuartige biomolekulare Technologien generiert werden, um Fragen in der Pneumologie zu beantworten. Unser aktueller Fokus liegt auf Short

**IHRE AUFGABEN**:

- Im Rahmen Ihres Promotionsprojekts in der Systemgenetik arbeiten Sie an verschiedenen Methoden und Anwendungen, welche genetische Variation mit biologischen Hochdurchsatzdaten, sogenannten OMICS-Daten, verknüpfen
- Analyse von Daten zu humanen und bakteriellen genetischen Varianten
- Verknüpfung von Genotypen mit molekularen Phänotypen über quantitative trait loci (QTL)-Analysen
- Verknüpfung von Genotypen mit Merkmalen und Krankheiten durch genomweite Assoziationsstudien (GWAS)
- Genetische Risikobewertung unter Verwendung sowohl etablierter als auch neuartiger polygener Scores
- Anwendung maschineller Lernansätze wie neuronaler Netze zur genombasierten Vorhersage von Lungenerkrankungen und -behandlungen
- Auswahl und Charakterisierung geeigneter Datensätze und Datenbanken, sowohl öffentlich als auch von Kooperationspartnern

**IHRE KOMPETENZEN**:

- Abgeschlossenes Studium (MSc oder äquivalent) in Bioinformatik oder verwandtem Fach mit relevantem interdisziplinärem Hintergrund
- Motivation, in Systemgenetik zu promovieren
- Grundkenntnisse der Molekularbiologie
- Programmierkenntnisse in mindestens einer Programmiersprache (vorzugsweise Python und R)
- Formale Ausbildung in maschinellem Lernen und/oder Erfahrung in der Anwendung maschinellen Lernens auf molekulare Daten
- Erfahrung in der Analyse genetischer Variantendaten sind ein starkes Plus (z.B. Dateiformate (VCF) und Programme (vcftools, bcftools, plink))
- Erste Erfahrungen mit Workflow-Management-Systemen, Versionskontrolle und High Performance Computing oder Lernbereitschaft
- Starkes Interesse sowohl an der Optimierung von Methoden als auch an deren Anwendung auf spezifische Fragestellungen in der
Pneumologie basierend auf vorhandenen OMICS-Daten

**UNSER ANGEBOT**:

- Teilzeit befristet auf 3 Jahre, Gehalt nach TVöD-VKA 13 inkl. Sozialleistungen
- Teil einer neu gegründeten Gruppe zu werden, die Kernkompetenzen der Bioinformatik aktiv auf hohem Niveau hält
- Eine wettbewerbsfähige Computerinfrastruktur, zugeschnitten auf die Analyse großer Variantendaten und Deep Learning
- Gestaltung des Machine Learning-Teils in kürzlich etablierten Systemgenetik-Projekten
- Unterstützung Ihrer akademischen Entwicklung durch Möglichkeiten zur Teilnahme an Workshops, Universitätskursen und Konferenzen
- Persönliche Atmosphäre, familienfreundliche Arbeitsbedingungen, flexible Arbeitszeiten, Kinderbetreuung, betriebl.Gesundheitsförderung,
Mobiles Arbeiten

Das FZB ist für das audit „beruf und familie“ zertifiziert und fördert gezielt die Vereinbarkeit von Beruf und Familie. Das unterrepräsentierte Geschlecht wird bei gleicher fachlicher und persönlicher Eignung besonders berücksichtigt. Ebenso werden Schwerbehinderte bei sonst gleicher Eignung bevorzugt berücksichtigt.

Weitere Informationen zu unserer Rekrutierungspolicy sowie unserer Zertifizierung „HR Excellence in Research“ finden Sie auf unserer Homepage.

Für uns sind Ihr Alter, Ihr Geschlecht und sexuelle Identität, Ihre Weltanschauung, Ihre ethnische Herkunft oder ein Handicap nicht von Bedeutung. Wir sind einzig und allein an Ihrem Wissen und Können und Ihrer Teamfähigkeit interessiert. Wenn auch für Sie attraktive Arbeitsinhalte und lösungsorientiertes Vorgehen wichtiger sind als Formalien, sind Sie bei uns richtig