Bachelor- / Masterarbeit - Bioprozessoptimierung

Unser Institutsbereich Biotechnologie (IBG-1) am Institut für Bio
- und Geowissenschaften ist führend für Bioprozessentwicklung im Bereich Industrielle Biotechnologie. Die Arbeitsgruppe Bioprozesse und Bioanalytik hat große Kompetenzen im Bereich der mikrobiellen Bioprozessentwicklung und Stammkonstruktion mit Werkzeugen und Workflows zur Laborautomatisierung, Miniaturisierung und Digitalisierung. Hier wird an innovativen Ansätzen zur zielgerichteten Durchmusterung von Stammbibliotheken und der Bioprozessentwicklung geforscht. Antimikrobielle Peptide haben in den letzten Jahren zunehmend an Bedeutung gewonnen. Sie werden von sogenannten mikrobiellen Starterkulturen hergestellt. Sie leisten einen Beitrag für die Sicherheit von Lebensmitteln und werden auch für den Einsatz im medizinischen Bereich diskutiert.

**Ihre Aufgaben**:
Antimikrobielle Peptide (AMP) sind nicht-toxische, kleine Moleküle, welche das Wachstum von Bakterien inhibieren oder diese abtöten können. Sie werden von der Mehrheit von Bakterien produziert und können gegen ein relativ enges oder breites Spektrum anderer Bakterien wirken. Dies führt zu einer Vielzahl an potentiellen Anwendungen, wie dem Einsatz von AMP gegen Lebensmittelpathogene in der Konservierung oder gegen antibiotikaresistente Humanpathogene in der Medizin. Die Gewinnung von AMPs soll mittels heterologer Produktion in dem industriellen Plattformorganismus Corynebacterium glutamicum über Proteinsekretion erfolgen. Mit Hilfe von Technologien zur Laborautomatisierung und Mikrokultivierung sind die beschleunigte Konstruktion von Stammbibliotheken, Bioprozessentwicklung und Produktanalytik für eine solche Anwendung möglich.

Ausgehend von bereits vorhandenen automatisierten Workflows zur Charakterisierung der Produktion von antimikrobiellen Peptiden im Mikrolitermaßstab soll mit ausgewählten Stämmen eine Bioprozessoptimierung betrieben werden. Der Fokus liegt dabei auf typischen Bioprozessparametern und Einflussfaktoren, die die Konzentration, Ausbeute und Stabilität von antimikrobiellen Peptiden beeinflussen könnten. Die Bioprozessoptimierung im batch und fed-batch Modus in der Mikrokultivierung soll bis in den Labormaßstab ausgeweitet werden.

Ihre Aufgaben im Detail
- Mikrobielle Kultivierung im Mikrokultivierungssystem BioLector innerhalb einer TECAN-Robotikplatform
- Mikrobielle Kultivierung im Labormaßstab (DASGIP Parallel Bioreactor Systems)
- Anwendung von automatisierten Assays zur Produktquantifizierung
- Selbstständige Datenauswertung und Präsentation der Ergebnisse
- Sorgfältige Dokumentation der durchgeführten Arbeiten

**Ihr Profil**:

- Sie studieren Biologie, Biotechnologie, Bioverfahrenstechnik oder eine verwandte Disziplin im Master
- oder Bachelorstudiengang
- Interesse an Mikrokultivierung, Robotik, Programmieren und Laborautomatisierung
- Bereitschaft sich in neue Methoden und einfache Programmierung mit Python einzuarbeiten
- Hohes Maß an Selbstständigkeit, Motivation und Zuverlässigkeit
- Sehr zuverlässige, strukturierte und ordentliche Arbeitsweise

**Unser Angebot**:
Wir arbeiten an hochaktuellen innovativen Themen und bieten Ihnen die Möglichkeit, den Wandel aktiv mitzugestalten Wir bieten Ihnen:

- Ein interessantes und gesellschaftlich relevantes Thema für ihre Abschlussarbeit mit zukunftsorientierter Themenstellung
- Eine exzellente wissenschaftliche Ausstattung und die neuste Technologie
- Qualifizierte und gewissenhafte Betreuung durch wissenschaftliche Kolleg
- innen
- Interdisziplinäre Zusammenarbeit in einem engagierten und kollegialen Team
- Eigenverantwortliche Vorbereitung und Durchführung der übertragenen Aufgaben
Die Möglichkeit zum (orts-)flexiblen Arbeiten, z.B. tlw. im Homeoffice

Wir freuen uns über Bewerbungen von Menschen mit vielfältigen Hintergründen, z.B. hinsichtlich Alter, Geschlecht, Behinderung, sexueller Orientierung / Identität sowie sozialer, ethnischer und religiöser Herkunft. Ein chancengerechtes, diverses und inklusives Arbeitsumfeld, in dem alle ihre Potentiale verwirklichen können, ist uns wichtig.