Masterarbeit im Bereich Bioinformatik: Entwicklung eines neuronalen Netzes zur Vorhersage essentieller Parameter

vor 4 Wochen


Leipzig, Sachsen, Deutschland Fraunhofer-Gesellschaft Vollzeit
Stellenbeschreibung

Wir suchen eine*n Masterstudent*in für eine Abschlussarbeit im Bereich Bioinformatik am Fraunhofer-Institut für Zelltherapie und Immunologie IZI in Leipzig.

Projektbeschreibung

Das Projekt beinhaltet die Entwicklung eines neuronalen Netzes zur computergestützten Vorhersage essentieller Parameter für Spatial Transcriptomics Workflows. Dabei soll ein Machine-Learning-Modell trainiert und validiert werden, um die wichtigsten Workflow-Parameter vorherzusagen. Die Arbeit soll anhand öffentlich zugänglicher gepaarter Datensätze zur Morphologie der Zellen sowie räumlich aufgelöster Expression im Gewebe durchgeführt werden.

Qualifikationen
  • Bachelor-Studium der Bioinformatik, Medizininformatik, Data Science, Informatik oder eines verwandten Faches
  • Kenntnisse in maschinellem Lernen, statistischem Lernen und neuronalen Netzen
  • Erfahrungen mit ML/DL-Frameworks und verwandter Software
  • Kenntnisse in Linux Kommandozeilen, Bash/Shell-Skripten und Git
  • Grundkenntnisse in Molekularbiologie
Was wir bieten
  • Enge Anbindung an die Industrie
  • Kreativer Forschungsfreiraum
  • Praxisorientierte Tätigkeit
  • Persönliche Betreuung

Wir wertschätzen und fördern die Vielfalt der Kompetenzen unserer Mitarbeitenden und begrüßen daher alle Bewerbungen.



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