Forschungsassistent im Bereich Medizinische Informatik

vor 4 Wochen


Münster, Nordrhein-Westfalen, Deutschland Universitätsklinikum Münster Vollzeit

(gn*=geschlechtsneutral)

Das Universitätsklinikum Münster sucht zum nächstmöglichen Zeitpunkt einen engagierten Forschungsassistenten für das Institut für Medizinische Informatik (IMI). Die Stelle ist projektbezogen und zunächst befristet.

Vollzeit mit 38,5 Wochenstunden
Vergütung je nach Qualifikation bis Entgeltgruppe 13 TV-L

Im Rahmen der "Medizininformatik-Initiative" (MII) fördert das Bundesministerium für Bildung und Forschung (BMBF) die digitale Vernetzung des deutschen Gesundheitssystems. Am Institut für Medizinische Informatik der Universität Münster wurde ein Medizinisches Datenintegrationszentrum (MeDIC) eingerichtet, um den Mehrwert der gemeinsamen Nutzung gesundheitsrelevanter Daten in Forschung und Versorgung zu erproben.

Das Projekt EyeMatics (Augenerkrankungen behandelt mit interoperabler medizinischer Informatik) ist ein zentraler Anwendungsfall, der durch das MeDIC Münster und die Klinik für Augenheilkunde koordiniert wird. Wir suchen ein neues Teammitglied, das die digitale Transformation im Gesundheitswesen aktiv mitgestalten möchte. Das Projekt wird durch das BMBF gefördert.

Im Rahmen des Projekts sollen reale Behandlungsdaten von Augenpatienten aus mehreren Universitätskliniken extrahiert werden, um einen harmonisierten Datensatz zu erstellen. Dieser Datensatz wird die Grundlage für ein neues ophthalmologisches Erweiterungsmodul der Medizininformatik-Initiative bilden. Die klinische und technische Koordination erfolgt am Standort Münster.

Aufgabengebiet:

  • Entwicklung von Kerndatensatzmodulen in FHIR sowie einer zugehörigen ETL-Pipeline
  • Einrichtung eines DICOM-Servers für bildgebende Daten der Augenheilkunde und Entwicklung einer entsprechenden ETL-Pipeline
  • Forschung und Implementierung von Verfahren des maschinellen Lernens, insbesondere im Bereich medizinischer Bilddaten
  • Optimierung und Erweiterung des Data Sharing Frameworks der Medizininformatik-Initiative
  • Umsetzung von Patientenbefragungen mithilfe der Mobilen Patientenbefragung (MoPat)

Profil:

  • Abgeschlossenes Masterstudium in Medizininformatik, Informatik, Wirtschaftsinformatik oder einem verwandten Fachgebiet
  • Interesse an medizinischen Daten der Augenheilkunde und digitalen Patientenbefragungen
  • Erfahrung in der Softwareentwicklung mit Java, insbesondere im Spring-Framework
  • Kenntnisse in der medizinischen Datenanalyse mit Python oder R
  • Vertrautheit mit Software als Medizinprodukt
  • Erfahrung in Datenintegration, ETL-Prozessen und Data Warehousing in der medizinischen Forschung
  • Gute Deutsch- und Englischkenntnisse

Wir bieten einen attraktiven und herausfordernden Arbeitsplatz, um einen nachhaltigen Beitrag zur Behandlung schwerer Augenerkrankungen zu leisten. Ein wichtiger Bestandteil unserer Unternehmenskultur ist der Austausch und das Networking untereinander. Team-Meetings, soziale Veranstaltungen und digitale Formate bieten zahlreiche Gelegenheiten zur Interaktion. Selbstverständlich gewährleisten wir eine umfassende Einarbeitung in die Grundlagen der Medizininformatik.



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