Technische Universität München (TUM)
Munich Data Science Institute

Wir suchen eine/n Datenverwalter/in / Bioinformatiker/in für das Munich Data Science Institute.

Haben Sie eine Leidenschaft für die Schnittstelle zwischen Datenwissenschaft, Bioinformatik und innovativen Technologien? Das Munich Data Science Institute (MDSI) an der Technischen Universität München (TUM) und das German Human Genome-Phenome Archive (GHGA) suchen einen talentierten Wissenschaftler oder eine talentierte Wissenschaftlerin zur Verstärkung unseres engagierten Teams. In der Rolle des Datenverwalters/Bioinformatikers tragen Sie entscheidend zur Weiterentwicklung der biomedizinischen Datenspeicherung, -analyse und -verbreitung bei, indem Sie modernste Cloud-Technologien und Arbeitsabläufe nutzen. Gemeinsam gestalten wir die Zukunft der Genommedizin und leisten einen bedeutenden Beitrag zur biomedizinischen Forschung.

Über uns
Das MDSI ist ein interdisziplinäres Institut an der TUM, das sich auf Data Science und Maschinelles Lernen konzentriert. Unsere Mission ist es, fortschrittliche Technologien und IT-Infrastrukturen innerhalb der Universität und darüber hinaus zu fördern und zu implementieren. In Kooperation mit dem GHGA, einem nationalen Netzwerk sicherer Datenzentren für die Archivierung und Verarbeitung von Human-Genom-Sequenzierungs- und anderen Omics-Daten, revolutionieren wir die Speicherung, Analyse und Verbreitung biomedizinischer Daten. Unsere Arbeit umfasst die Anwendung von Cloud-Technologien und die Implementierung neuester Tools und Arbeitsabläufe. Das GHGA-Team an der TUM wird vom Lehrstuhl für Computational Molecular Medicine unterstützt und ist eng mit der lokalen Forschungsgemeinschaft verbunden, während es gleichzeitig die Zusammenarbeit in nationalen und internationalen Konsortien fördert.

Aufgabenbeschreibung
In der Funktion als Bioinformatiker/in sind Sie verantwortlich für die Entwicklung, Evaluierung und Implementierung von Next Generation Sequencing (NGS)-Workflows innerhalb des GHGA. Sie arbeiten in einer Hochdurchsatzumgebung und nutzen die in Zusammenarbeit mit dem Leibniz Rechenzentrum (LRZ) entwickelte OpenStack-Plattform zur Verbesserung und Sicherung der GHGA Cloud-Infrastruktur. Zudem sind Sie Mitglied des nationalen GHGA-Konsortiums, wo Sie moderne Methoden und NGS-Workflows entwickeln, optimieren und anwenden. Sie gewährleisten die Harmonisierung der Workflow-Anwendungen über die Data Hubs hinweg. Als Teil des MDSI organisieren Sie Hackathons und Workshops und unterstützen vielfältige Aktivitäten im Bereich Forschungsdatenmanagement an der TUM. Ihr Fachwissen und Ihre aktive Teilnahme an der lokalen Forschungsgemeinschaft tragen zur strategischen Entwicklung zukünftiger Dienstleistungen an der Universität bei, wobei Sie Unterstützung und Beratung bei Projekten bieten, die Expertise im Forschungsdatenmanagement erfordern. Insgesamt verbringen Sie mehr als 50% Ihrer Arbeitszeit mit Forschungsaktivitäten.

Anforderungen
- Fundierte Kenntnisse in der Entwicklung und Anwendung von NGS/Omics-Workflows (z.B. NextFlow, snakemake, WDL)
- Erfahrung im Benchmarking von NGS-Workflows
- Sicherer Umgang mit der OpenStack-Plattform zur Anpassung und Bereitstellung des GHGA-Software-Stacks
- Vertrautheit mit Methoden und Tools der Bioinformatik und des Forschungsdatenmanagements
- Kenntnisse in der Verwaltung von Linux-Systemen und Containern
- Ausgezeichnete organisatorische Fähigkeiten zur Koordination von Workshops, Hackathons und Seminaren
- Effektive Kommunikations- und zwischenmenschliche Fähigkeiten zur Interaktion mit der lokalen Forschungs-gemeinschaft und zur Unterstützung des strategischen Planungsprozesses
- Masterabschluss oder höher in der Bioinformatik, Informatik oder verwandten Fachrichtungen.

Warum Sie sich uns anschließen sollten
- Möglichkeit, an vorderster Front die biomedizinische Forschung durch innovative datenwissenschaftliche und bioinformatische Ansätze voranzutreiben
- Internationales, attraktives und interdisziplinäres Arbeitsumfeld
- Zusammenarbeit mit führenden IT-Partnern
- Gehalt gemäß TV-L inklusive Sozialleistungen
- Flexible Arbeitszeiten und Home-Office-Regelung
- Möglichkeiten zur weiteren wissenschaftlichen Qualifikation und persönlichen Entwicklung.

Die Technische Universität München fördert ausdrücklich die Bewerbung von Frauen und allen anderen Personen, die zusätzliche Diversitätsdimensionen in die Forschungs- und Lehrstrategien der Universität einbringen können. Die Stelle ist für die Besetzung mit schwerbehinderten Menschen geeignet.