Naturwissenschaftlicher Doktorand

Wir suchen für den Bereich „Mikrobielle Genomplastizität“ des
**Instituts für Hygiene** - (Leiter: Prof. Dr. rer. nat. U. Dobrindt) im Rahmen eines Forschungsprojektes zum nächstmöglichen Zeitpunkt befristet auf 3 Jahre Sie

**Teilzeitbeschäftigt mit 65%**

**Vergütung je nach Qualifikation und Aufgabenübertragung nach TV-L E13**

Unsere Gruppe beschäftigt sich mit der Charakterisierung von Pathogenitäts
- und Fitnesseigenschaften bei uropathogenen Escherichia coli. In diesem Zusammenhang verwenden wir vergleichende genombasierte und funktionale Ansätze zur Untersuchung der Interaktion zwischen den infizierenden Bakterien und dem infizierten Gewebe des Wirtes.

Die ausgeschriebene Stelle bezieht sich auf die Erforschung der spezifischen Interaktion zwischen uropathogenen E. coli und dem Wirt bei Infektionen der oberen und unteren Harnwege. Der Schwerpunkt liegt auf der (i) vergleichenden Genomik von klinischen uropathogenen E. coli Isolaten aus Patienten mit Nierenbecken
- oder Blaseninfektion, (ii) der Untersuchung globaler Transkriptionsprofile uropathogener E. coli und des Wirtes in Nieren und der Blase, (iii) funktionale Charakterisierung von bakteriellen Pathogenitätsfaktoren, die für die Infektion der Niere wichtig sind.

**Ihr Aufgabenbereich**:

- Komparative Genomik mit klinischen uropathogenen E. coli Isolaten
- Analyse der Genexpression uropathogener E. coli und des Wirtes in der Blase bzw. Niere durch dual RNA-seq (experimentelles murines Modell für aufsteigende Harnwegsinfektionen)
- Funktionale Charakterisierung bakterieller Pathogenitätsfaktoren (Mutagenese klinischer uropathogener E. coli Isolate, eukaryotische Zellkultur, Expressionsstudien ausgewählter Gene)
- Interpretation der Ergebnisse, statistische Analyse der Daten
- Erstes Erarbeiten von wissenschaftlichen Texten im Zusammenhang mit dem Dissertationsprojekt

**Wir freuen uns auf**:

- Master in Biologie, Biochemie, Biowissenschaften, Biotechnologie oder Molekulare Biomedizin
- Sehr gute Vorkenntnisse in Mikro
- und Molekularbiologie, bakteriellen Genom
- und Transkriptomanalysen
- Bereitschaft zur Anwendung experimenteller Modelle für Harnwegsinfektionen
- Bereitschaft für das Arbeiten mit NGS Datensätzen (idealerweise liegen bereits Vorkenntnisse in Linux und der Verarbeitung von NGS Datensätzen vor)
- Hohe Motivation und die Entwicklung eines eigenständigen Arbeitsstils
- Teamfähigkeit und soziale Kompetenz

**Wir bieten Ihnen**:

- Eine gute Arbeitsatmosphäre in einem interdisziplinären Team
- Eine sehr gute apparative Ausstattung der Forschungslabor und gute Vernetzung mit anderen wissenschaftlichen Arbeitsgruppen
- Eine strukturierte und intensive Einarbeitung sowie eine umfassende Promotionsbetreuung mit der Möglichkeit zur Entwicklung eines eigenen wissenschaftlichen Profils mit entsprechender methodischer Expertise
- Die Möglichkeit zur Teilnahme an (inter-)nationalen Kongressen mit eigener Präsentation der Forschungsarbeit

Wir freuen uns auf Ihre
**Bewerbung**
**ausschließlich**
**über unser Karriereportal** bis zum
**08.02.2023**.

Das
**Universitätsklinikum Münster** ist eines der führenden Krankenhäuser Deutschlands. Eine solche Position erlangt man nicht nur durch Größe und medizinische Erfolge. Wichtig ist das Engagement jedes Einzelnen. Wir brauchen Ihr Engagement, um selbst im Kleinen Großes für unsere Patienten leisten zu können. Dafür bieten wir Ihnen viele Möglichkeiten, damit Sie selbst weiter wachsen können.