Data Scientist

vor 3 Wochen


Munich, Deutschland Technische Universität München Vollzeit

**Wir suchen zum nächstmöglichen Zeitpunkt in Vollzeit eine/n Data Scientist / Bioinformatiker/in für das Munich Data Science Institute**

Die offene Stelle wird gemeinsam vom Munich Data Science Institute (MDSI) und dem Deutschen Human Genom-Phenom Archiv (GHGA) besetzt. Das neu gegründete MDSI an der Technischen Universität München (TUM) hat einen interdisziplinären und fakultätsübergreifenden Fokus auf dem Gebiet der Datenwissenschaften und des maschinellen Lernens. Es fungiert als Vermittler und Multiplikator von modernsten Technologien und IT-Infrastrukturen für die gesamte Universität. Zusammen mit GHGA, einem nationalen sicheren und vertrauenswürdigen Netzwerk von Datenzentren für die Archivierung, Verarbeitung und Bereitstellung von Humangenomsequenzierungsund anderen Omics-Daten für die biomedizinische Forschung, gestaltet das MDSI die Art und Weise, wie biomedizinische Daten in Zukunft gespeichert, analysiert und verbreitet werden, indem es Cloud
- Technologien und modernste Tools und Arbeitsabläufe nutzt. Das lokale GHGA-Team ist am Lehrstuhl für Computational Molecular Medicine an der TUM angesiedelt und arbeitet gut mit der lokalen Forschungsgemeinschaft zusammen.

**Stellenbeschreibung**

Als Bioinformatiker/in werden Sie Next Generation Sequencing (NGS)-Workflows entwickeln, benchmarken und ausführen sowie Omics-Daten in einer Hochdurchsatzumgebung innerhalb von GHGA analysieren. Die NGS-Workflows werden auf der OpenStack-Plattform ausgeführt, die gemeinsam mit dem Leibniz-Rechenzentrum (LRZ) und GHGA entwickelt wird. Dies wird auch die Weiterentwicklung der Cloud selbst vorantreiben. Als Mitglied des bundesweiten GHGA-Konsortiums werden Sie ein breites Spektrum an hochmodernen Methoden entwickeln und anwenden, um NGSWorkflows zu verbessern und den lokalen Workflow-Einsatz zu verbessern und zu sichern. Als MDSI-Mitglied organisieren Sie Hackathons und Workshops und unterstützen diverse Forschungsdatenmanagement-Aktivitäten an der TUM. Indem Sie aktiv mit der lokalen Forschungsgemeinschaft interagieren und Ihre Expertise in Bioinformatik und Forschungsdatenmanagement an der TUM einbringen, werden Sie in die strategische Entwicklung zukünftiger Dienstleistungen an der TUM als Ganzes eng eingebunden.

**Ihr Aufgabengebiet**
- Entwicklung von NGS/Omics-Workflows
- Anwendung und Benchmarking von State-of-the-Art NGS-Workflows
- Entwicklung, Anpassung und Einsatz von GHGA Software Stacks
- Sicherung des GHGA-Workflow-Einsatzes mittels OpenStack-Infrastruktur
- System/Image/Container (Linux) Verwaltung
- Organisation von Workshops, Hackathons und Seminaren
- Unterstützung des Forschungsdatenmanagements an der TUM
- Unterstützung von Förderanträgen mit Forschungsdatenmanagementstrategien

**Anforderungen**
- Abgeschlossenes Hochschulstudium in Bioinformatik, Informatik oder verwandten Fächern
- Praktische Erfahrung mit Next-Generation Sequencing Pipelines (NextFlow, snakemake, WDL,...)
- Kenntnisse in der Arbeit in einem UNIX-basierten Ökosystem (teilweise Administration)
- Kenntnisse in mindestens einer Programmiersprache (Python, Java, R, Go,...) Kenntnisse über Forschungsdatenmanagementpläne und verwandte Technologien Ausgezeichnete Kommunikationsfähigkeiten in Englisch (Kommunikation mit Konsortialmitgliedern)
- Fähigkeit, Fristen einzuhalten und Prioritäten zu setzen, um ein vielfältiges Arbeitspensum zu bewältigen

**Wünschenswert, aber nicht erforderlich**
- Erfahrung mit Cloud-Computing-Infrastrukturen (OpenStack)
- Erfahrungen in der Organisation von Workshops und Hackathons
- Kommunikationsfähigkeiten in deutscher Sprache (Kommunikation mit lokalen Partnern)

**Wir bieten**
- Einen interessanten und vielseitigen Arbeitsplatz
- Internationales, attraktives und interdisziplinäres Arbeitsumfeld
- Zusammenarbeit mit weltweit führenden IT-Partnern wie dem Leibniz-Rechenzentrum (LRZ)
- Vergütung nach TV-L inklusive Sozialleistungen
- Flexible Arbeitszeiten und Home-Office-Regelung
- Möglichkeiten zur wissenschaftlichen Weiterqualifizierung und zur persönlichen Entwicklung
- Schwerbehinderte Bewerber/innen werden bei gleicher Eignung und Qualifikation besonders berücksichtigt
- Die TUM strebt eine Erhöhung des Frauenanteils an, Bewerbungen von Frauen sind daher ausdrücklich erwünscht

**Bewerbung**

Die Vollzeitstelle ist befristet für max. 3 Jahre bis 30. September 2025 mit einer Vergütung in Anlehnung an den TV-L (Tarifvertrag für den öffentlichen Dienst). Die Einstellung erfolgt zum nächstmöglichen Zeitpunkt.

Mit dem Absenden Ihrer Bewerbung bestätigen Sie, dass Sie die Datenschutzhinweise der TUM gelesen haben.

**Weitere Informationen**

Prof. Dr. Stephan Günnemann

Technische Universität München

Munich Data Science Institute

Walther-von-Dyck-Straße 10

85748 Garching bei München

**Hinweis zum Datenschutz**:
Im Rahmen Ihrer Bewerbung um eine Stelle an der Technischen Universität München (TUM) übermitteln Sie personenbezogene Date


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    Seit 1989 bietet die CompuSafe Data Systems AG von ITbavaria.de maßgeschneiderte IT-Services und IT-Transformation für Unternehmenskund:innen in langfristigen, partnerschaftlichen Geschäftsbeziehungen. Unser tiefes Verständnis der Herausforderungen und Prozesse unserer Kund:innen ermöglicht es uns, zielgenaue Lösungen für deren komplexe Probleme...


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    Daiichi Sankyo Europe is creating a Digital Innovation Hub to accelerate the development and scaling of digital solutions across our European organization. The Digital Innovation Hub acts as an internal solution incubator and serves as a catalyst for Daiichi Sankyo Europe to deliver best-in-class customer experience for relevant digital content, solutions...

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    Machine Learning Reply Deutschland arbeitet mit seinen Kunden an innovativen Data-Science-Projekten, für die wir Data Scientists mit einem starken technischen Hintergrund suchen. Machine Learning Reply bietet maßgeschneiderte End-to-End-Lösungen im Data-Science-Bereich an, die den gesamten Projektlebenszyklus abdecken - von der initialen...

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    Who We AreBoston Consulting Group partners with leaders in business and society to tackle their most important challenges and capture their greatest opportunities. BCG was the pioneer in business strategy when it was founded in 1963. Today, we work closely with clients to embrace a transformational approach aimed at benefiting all stakeholders—empowering...

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    Ariadne is seeking a highly skilled Senior Data Scientist to join our growing team. You will have the opportunity to work with cutting-edge technology, collaborate with a team of talented analysts and developers to build innovative ML solutions, and help shape the future of brick-and-mortar businesses to meet our client’s needs. As a member of the Data...

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    Zentrale- München- Im Überblick - Senior, Professional- Vollzeit- Festanstellung- Dein Profil: Experte für Sprachmodelle - Hervorragender Studienabschluss (Master oder PhD) - Veröffentlichungen im Bereich Deep Learning (mit Fokus auf Sprache) - Fähigkeit zum unabhängigen Erarbeiten und Implementieren von Deep Learning Modellen (z.B. in...

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    Munich, Deutschland engaged & Company GmbH Vollzeit

    **Highlights der Stelle**: - Duz-Kultur - Überdurchschnittliches Gehalt + Regelmäßige Anpassung - 38 Std / Woche **Firmenprofil**: Für ein Telekommunikationsunternehmen, suchen wir zum nächstmöglichen Zeitpunkt für den Standort Kempten einen Data-Scientist (m/w/d) in Festanstellung Die Betreuung und Vermittlung sowie alle unsere weiteren...

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    Dafür steht seit über 200 Jahren die Versicherungskammer Bayern. Datenanalyst / Data Scientist (d/w/m) Value Added Services in München Bei uns, der Versicherungskammer Bayern, suchen wir einen leidenschaftlichen Datenanalysten/Data Scientist, der in unserem Team für Value Added Services in München eine wichtige Rolle einnimmt. Hier bist du nicht nur...

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    Munich, Deutschland Ocell GmbH Vollzeit

    Tasks - You will further develop and improve the data-driven systems in OCELL - You will work with classical data pipelines as well as machine learning systems - You help us to further code quality, great software engineering and data-driven thinking **Requirements**: - You completed a master‘s degree in Computer Science, Mathematics, Data Engineering...

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