Doktorand/-in (w/m/d)

In der Doktorand/-in (w/m/d) Einsatzort: Klinik für Gastroenterologie, Stoffwechselerkrankungen und Internistische Intensivmedizin -AG Strnad - (Med. Klinik III)  Arbeitszeit: 65% der vollen tariflich vereinbarten Arbeitszeit (zzt. 38,5 Std./W.) Befristung: Zunächst unter Berücksichtigung des WissZeitVG für 3 Jahre, mit Promotionsmöglichkeit Einstieg: zum nächstmöglichen Zeitpunkt Vergütung: EG 13 (TV-L) Projekt:  Alpha1-Antitrypsin (AAT) ist ein sekretiertes hepatozelluläres Protein. AAT-Mutationen führen dazu, dass AAT im endoplasmatischen Retikulum (ER) zurückgehalten wird, was zu einem AAT-Mangel (AATM) führt. Lebererkrankung gehört zu den führenden Todesursachen bei AATM und gilt als Modellerkrankung für proteotoxischen Stress, doch die hepatische Manifestation weist eine große interindividuelle Variabilität auf. Unsere Klinik hat in den letzten 10 Jahren eine weltweit einzigartige Kohorte von AATM-Patientinnen/Patienten und den zugehörigen Biomaterialien zusammengestellt. Während Ihrer Doktorarbeit werden Sie diese Proben nutzen, um die bisher weitgehend unverstandene Pathogenese der AATM-Erkrankung und den Einfluss verschiedener Faktoren zu erforschen. Dabei werden in-vivo Konditionen in von Patientinnen/Patienten stammenden induzierten pluripotenten Stammzellen (iPSCs) nachgeahmt und die humanen Proben mittels Deep Visual Proteomics (DVP) und Einzelzellproteomik (SCP) untersucht. Ein besonderer Fokus soll zudem auf der Auswertung von spatial transcriptomic Analysen von AATM Lebern liegen. Ihre Aufgaben Bioinformatische Auswertung verschiedener omischer Messungen (SCP, spatial transcriptomicsm, RNAseq) Validierung der gefundenen Signalwege in Zell-/Modellorganellen (Zellkultur, iPSCs) Biochemische, molekularbiologische und pathologische Techniken Ihr Profil Erfolgreich abgeschlossenes Hochschulstudium (Diplom, Master oder vergleichbar) in Biologie, Biotechnologie, Biochemie, Pharmazie oder Humanbiologie/Molekularmedizin  Erfahrung in experimenteller/bioinformatischer Forschung und Interesse an Immunologie, Zell- und Molekularbiologie Wünschenswert: Gute Englischkenntnisse in Wort und Schrift (Level C1) Grundkenntnisse der Bioinformatik Erfahrung: in der bioinformatischen Datenanalyse in experimenteller Forschung und Interesse an Bioinformatik, Immunologie, Zell- und Molekularbiologie  mit transgenen Tiermodellen und Modellorganismen mit wesentlichen Techniken der Zell- und Molekularbiologie in der Zellkultur Teamfähigkeit, Flexibilität und strukturiertes Arbeiten Freude am kooperativen und interdisziplinären Arbeiten Starkes Interesse an neuen Methoden Interesse an Grundlagen- und translationaler Forschung Wir bieten… 30 Tage Urlaub/Jahr Mitarbeitende werben Mitarbeitende für verschiedene Berufsgruppen / Prämie von 3.000 Euro Überdurchschnittliche betriebliche Altersversorgung der VBL  Fort- und Weiterbildungsmöglichkeiten  Entspannter Arbeitsweg  - vergünstigtes ÖPNV-Ticket oder Parkplatz sowie Möglichkeit der Teilnahme an der GoFlux App Familienfreundliche Unternehmenskultur (Betriebskindergarten, Ferienfreizeiten für Kids und ein Familienservicebüro) Eine Onboarding-App für neue Mitarbeitende Verlängerte Öffnungszeiten unseres Personalrestaurants Fit & Gesund - von Gesundheitsförderung bis Hochschulsport – wir haben alles für Sie Unser stressfreier Bewerbungsprozess: Schritt 1: Schnell und einfach bewerben - mit oder ohne Lebenslauf. Schritt 2: Wir nehmen Kontakt auf und besprechen, ob wir noch weitere Unterlagen benötigen. Schritt 3: Im persönlichen Gespräch lernen wir uns gegenseitig kennen. Schritt 4: Wir haben ein Match - dann kommt das Vertragsangebot Schritt 5: Nach der Unterschrift starten wir mit dem Onboarding und organisieren alles für den ersten Arbeitstag. Es gibt noch offene Fragen? Gerne trotzdem bewerben Wir beantworten alle Fragen in einem persönlichen Gespräch. Wir freuen uns